Un examen o anàlisi bacteriològic permet trobar i identificar els bacteris implicat en a infecció.

Depenent del lloc de la infecció, són possibles diverses anàlisis:

• examen bacteriològic de orina o ECBU
• examen bacteriològic de tamborets (veure cultura de la tija)
• examen bacteriològic de secrecions cervico-vaginals en dones
• examen bacteriològic de esperma en humans
• examen bacteriològic de secrecions bronquials o esput
• examen bacteriològic de hisopos de gola
• examen bacteriològic de ferides de la pell
• examen bacteriològic de líquid cefaloraquidi (veure punció lumbar)
• examen bacteriològic de sang (veure hemocultura)

Aquest tipus d’examen no es prescriu sistemàticament en cas d’infecció. Molt sovint, davant d’una infecció d’origen bacterià, el metge prescriu antibiòtics empíricament, és a dir “a l’atzar”, que és suficient en la majoria dels casos.

No obstant això, diverses situacions poden requerir la presa d’una mostra i una anàlisi bacteriològica precisa:

• infecció en una persona immunodeprimida
• infecció que no es cura amb antibiòtics (i, per tant, probablement resistent als primers antibiòtics administrats)
• infecció nosocomial (que es produeix a l'hospital)
• infecció potencialment greu
• intoxicació alimentària col·lectiva
• dubte sobre la naturalesa viral o bacteriana de la infecció (per exemple, en cas d'angina o faringitis)
• diagnòstic de certes infeccions com la tuberculosi
• etcètera...